上海市金山铁路支线改建工程建成通车后，将按照城际快铁模式运营，设计区段旅客列车速度为160公里/小时，列车开行分为金山至上海南站一站直达、站站停两种运营方式，其中一站直达旅行时间仅需30分钟，站站停旅行时间约为45分钟。列车运营将保证满足开行客车近期36对/日、远期52对/日和高峰小时的运输能力安排。近期高峰时段，金山直达上海南站列车每5分钟连开两班、平峰时段20—30分钟每班。据悉，该项目工程运用铁路网开行市郊客车，在全国范围内属首例。

上海市金山铁路支线改建工程范围是金山客站至上海南站。上海南站至新桥站增建三、四线，新桥站至金山站增建二线。该线路沿途设莘庄、春申、新桥、闵西、叶榭、亭林、阮巷站，线路总长58公里，金山区境内23.4公里。其中，金山区将新设亭林站和金山客站，改造阮巷站。该工程还包括新建及既有铁路电气化改造，通信、信号配套改造。建设周期为二年，工程投资总额48亿元。