唯一拥有高架段的3号线，在环境设计上也专门做了方案。环评报告认为，本次建设规划的3号线南段高架线（丹霞路站至方兴大道站段约3km，设高架站两座）沿翡翠路（一级主干道，红线宽度60m，两侧各有20m宽绿化带）敷设路段位于1类声环境功能区，且两侧规划为居住用地和科教用地，目前分布有合肥工业大学翡翠湖校区、安徽农大涉外经济学院、安徽水利水电职业技术学校等学校及学林雅苑、翡翠花园等小区。
考虑到3号线南段高架线所在区域声环境敏感目标较多，声环境质量要求较高，较为敏感，评价建议3号线南段高架线应采取全封闭声屏障。
5号线金寨路站至寿春路站地下隧道沿蒙城路敷设，路段将下穿安徽省博物馆陈列大楼建设控制地带范围，环评报告认为，线路走向及敷设方式总体合理，本轮轨道交通建设规划与城市紫线规划总体协调。
根据《文物保护法》的相关规定，下阶段具体设计方案需征求安徽省文物局的意见，并报城乡规划部门批准。
